1898年10月27日，康有为乘英国客轮“重庆”号逃抵日本。当他要上岸时，却遭到日本政府的刁难。与他在维新时期受到日本政界广泛欢迎的情形大不相同，日本的山县有朋内阁认为，清国的维新运动已经失败，维新派在清国政治舞台上已难有作为，因此对康有为态度十分冷淡，甚至拒绝康有为在神户上岸。无奈之下，康有为只好写信给自己在日本的弟子欧榘甲求助。此时，清国驻日公使李盛铎已得知康有为来到日本，立即致电清国政府。慈禧太后旋即命令李盛铎派密探跟踪康有为，伺机抓捕。日本另外一些人士认为，在这样险恶的情势下，日本政府不准康有为登岸的命令，无异于帮助清国政府共同谋害康有为。在品川弥二郎等日本人士的力争下，康有为终于得以入境。

当康有为刚到日本时，孙中山也正在日本招兵买马，准备发动革命推翻清国殖民政府。日本人想借此机会促成革命派与亲满改良派的合作，孙中山为扩大队伍也非常希望争取改良派。于是，在日本人宫崎滔天（宫崎寅藏）、平山周居间联络下，孙中山多次与康有为商谈合作事宜，要求康有为放弃亲满保皇主张，实行“革命的办法”来拯救中国，携手推翻清国殖民政府，以光复中国。但康有为坚持“不忘圣上（光绪皇帝）知遇之恩”的冥顽立场，拒绝与革命派合作来对抗清国，谈判最后无果而终。